Tijela Fonda su Upravni odbor i direktor Fonda.
Upravni odbor upravlja Fondom, a direktor zastupa i predstavlja Fond.
Direktor vodi poslovanje Fonda te obavlja druge poslove propisane Zakonom, a djelokrug ovlaštenja i odgovornosti direktora utvrđeni su Statutom Fonda.
DIREKTOR
Luka Balen, dipl.oec.
e-mail: direktor@fzoeu.hr
ZAMJENIK DIREKTORA
Mirko Budiša, dipl.ing.kem.tehn.
e-mail: mirko.budisa@fzoeu.hr
URED DIREKTORA
Hrvojka Petrović, dipl.iur., voditeljica Ureda direktora
e-mail: hrvojka.petrovic@fzoeu.hr
Teo Čolan, dr.vet.med., savjetnik direktora
e-mail: teo.colan@fzoeu.hr
Ljiljana Bukovec, dipl. oec., savjetnica direktora
e-mail:ljiljana.bukovec@fzoeu.hr
Irena Dubravec, dipl. ing. str., savjetnica direktora
e-mail: irena.dubravec@fzoeu.hr
Petra Zgomba, dipl.iur., savjetnica direktora
e-mail: petra.zgomba@fzoeu.hr
Helena Iveković, dipl.iur., savjetnica direktora
e-mail: helena.ivekovic@fzoeu.hr
Katarina Busak, dipl.iur., savjetnica direktora
e-mail: katarina.busak@fzoeu.hr
SLUŽBA ZA ODNOSE S JAVNOŠĆU
Lidija Tošić, struč.spec.ing.admin.chris., voditeljica Službe
e-mail: lidija.tosic@fzoeu.hr
TAJNIŠTVO
Andrea Bartolić, dipl.iur., tajnik Fonda
e-mail: andrea.bartolic@fzoeu.hr
SEKTOR ZA ZAŠTITU OKOLIŠA
Aleksandra Čilić,dipl.ing.sig., načelnica
e-mail: aleksandra.cilic@fzoeu.hr
SEKTOR ZA ENERGETSKU UČINKOVITOST
Ines Božičević, dipl. ing. traff., načelnica
e-mail: ines.bozicevic@fzoeu.hr
SEKTOR ZA GOSPODARENJE POSEBNIM KATEGORIJAMA OTPADA
Zvonimir Majić, dipl.oec., načelnik
e-mail: zvonimir.majic@fzoeu.hr
SEKTOR ZA FONDOVE EUROPSKE UNIJE
Maja Feketić, dipl.ing.građ., načelnica
e-mail: maja.feketic@fzoeu.hr
SEKTOR ZA FINANCIJSKE POSLOVE
Sanja Pokupec Lepanović, dipl.oec., načelnica
e-mail: sanja.pl@fzoeu.hr
SEKTOR ZA PRAVNE POSLOVE
Srđana Piasevoli, dipl.iur., načelnica
e-mail: srdana.piasevoli@fzoeu.hr
SAMOSTALNA SLUŽBA ZA UNUTARNJU REVIZIJU
Irenka Gerenđir, dipl.oec., voditeljica
e-mail: irenka.gerendir@fzoeu.hr
SAMOSTALNA SLUŽBA ZA NABAVU
Martina Karačić, dipl.iur., voditeljica
e-mail: martina.karacic@fzoeu.hr
SAMOSTALNA SLUŽBA - POSREDNIČKO TIJELO
Sanja Jelačić, dipl.oec., voditeljica
e-mail: sanja.jelacic@fzoeu.hr
SAMOSTALNA SLUŽBA ZA KONTROLING I POSLOVNE PROCESE
Kristina Ćubela, prof., voditeljica
e-mail: kristina.cubela@fzoeu.hr